MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidiphilium cryptum JF-5 chromosome

Total Repeats: 90347

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009484	TTC	2	6	22601	22606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148259046
502	NC_009484	CG	3	6	22636	22641	0 %	0 %	50 %	50 %	148259046
503	NC_009484	GGC	2	6	22642	22647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259046
504	NC_009484	GCCGC	2	10	22680	22689	0 %	0 %	40 %	60 %	148259046
505	NC_009484	TGCGC	2	10	22693	22702	0 %	20 %	40 %	40 %	148259046
506	NC_009484	CCG	2	6	22735	22740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259046
507	NC_009484	CGCC	2	8	22741	22748	0 %	0 %	25 %	75 %	148259046
508	NC_009484	CTG	2	6	22772	22777	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259046
509	NC_009484	CAT	2	6	22823	22828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259046
510	NC_009484	CTG	2	6	22847	22852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259046
511	NC_009484	GCC	2	6	22862	22867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259046
512	NC_009484	CG	4	8	22873	22880	0 %	0 %	50 %	50 %	148259046
513	NC_009484	TCA	2	6	22890	22895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259046
514	NC_009484	GC	3	6	22943	22948	0 %	0 %	50 %	50 %	148259046
515	NC_009484	TCCG	2	8	22953	22960	0 %	25 %	25 %	50 %	148259046
516	NC_009484	ATG	2	6	23025	23030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	148259046
517	NC_009484	CCG	2	6	23133	23138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259046
518	NC_009484	GC	4	8	23160	23167	0 %	0 %	50 %	50 %	148259046
519	NC_009484	GGC	2	6	23203	23208	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259046
520	NC_009484	GCT	2	6	23212	23217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259046
521	NC_009484	CGG	2	6	23254	23259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259046
522	NC_009484	GC	3	6	23305	23310	0 %	0 %	50 %	50 %	148259046
523	NC_009484	CTGG	2	8	23323	23330	0 %	25 %	50 %	25 %	148259046
524	NC_009484	TGCC	3	12	23374	23385	0 %	25 %	25 %	50 %	148259046
525	NC_009484	CTG	2	6	23414	23419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259046
526	NC_009484	CCTT	2	8	23437	23444	0 %	50 %	0 %	50 %	148259046
527	NC_009484	GTC	2	6	23459	23464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259046
528	NC_009484	GCG	2	6	23496	23501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259046
529	NC_009484	CGC	2	6	23511	23516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259046
530	NC_009484	CGG	2	6	23523	23528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259046
531	NC_009484	TCG	2	6	23553	23558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259046
532	NC_009484	GCG	2	6	23588	23593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259046
533	NC_009484	GCGG	2	8	23602	23609	0 %	0 %	75 %	25 %	148259046
534	NC_009484	CGA	2	6	23623	23628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259046
535	NC_009484	GGT	2	6	23629	23634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148259046
536	NC_009484	GCG	2	6	23639	23644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259046
537	NC_009484	ACG	2	6	23676	23681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259046
538	NC_009484	GGC	2	6	23705	23710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259047
539	NC_009484	CAT	2	6	23724	23729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259047
540	NC_009484	CGA	2	6	23792	23797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259047
541	NC_009484	GGT	3	9	23826	23834	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148259047
542	NC_009484	CGA	2	6	23844	23849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259047
543	NC_009484	CGG	2	6	23895	23900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259047
544	NC_009484	GCCG	2	8	23979	23986	0 %	0 %	50 %	50 %	148259047
545	NC_009484	AGC	2	6	23999	24004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259047
546	NC_009484	CGC	2	6	24009	24014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259047
547	NC_009484	TCCT	2	8	24025	24032	0 %	50 %	0 %	50 %	148259047
548	NC_009484	GTC	2	6	24082	24087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259047
549	NC_009484	CTG	2	6	24091	24096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259047
550	NC_009484	ATC	2	6	24109	24114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259047
551	NC_009484	CCG	2	6	24140	24145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259047
552	NC_009484	CG	3	6	24253	24258	0 %	0 %	50 %	50 %	148259048
553	NC_009484	GGC	2	6	24261	24266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259048
554	NC_009484	CGG	2	6	24291	24296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259048
555	NC_009484	CCGC	2	8	24299	24306	0 %	0 %	25 %	75 %	148259048
556	NC_009484	GC	3	6	24305	24310	0 %	0 %	50 %	50 %	148259048
557	NC_009484	GGC	2	6	24409	24414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259048
558	NC_009484	CGGC	2	8	24420	24427	0 %	0 %	50 %	50 %	148259048
559	NC_009484	CCG	2	6	24472	24477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259048
560	NC_009484	CGG	2	6	24567	24572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259048
561	NC_009484	CG	3	6	24586	24591	0 %	0 %	50 %	50 %	148259048
562	NC_009484	GCG	3	9	24589	24597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259048
563	NC_009484	GAC	2	6	24643	24648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259048
564	NC_009484	GCC	2	6	24664	24669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259048
565	NC_009484	ACG	2	6	24676	24681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259048
566	NC_009484	AGC	2	6	24686	24691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259048
567	NC_009484	GCC	3	9	24692	24700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259048
568	NC_009484	CGC	4	12	24702	24713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259048
569	NC_009484	CCG	2	6	24725	24730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259048
570	NC_009484	ACG	2	6	24734	24739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259048
571	NC_009484	GCA	2	6	24762	24767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259048
572	NC_009484	GC	3	6	24806	24811	0 %	0 %	50 %	50 %	148259048
573	NC_009484	GCA	2	6	24813	24818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259048
574	NC_009484	TGC	2	6	24821	24826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259048
575	NC_009484	CG	3	6	24894	24899	0 %	0 %	50 %	50 %	148259048
576	NC_009484	ACA	3	9	24926	24934	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148259048
577	NC_009484	CCGG	2	8	24978	24985	0 %	0 %	50 %	50 %	148259048
578	NC_009484	GGT	2	6	24987	24992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148259048
579	NC_009484	GCG	2	6	25016	25021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259048
580	NC_009484	CG	3	6	25057	25062	0 %	0 %	50 %	50 %	148259048
581	NC_009484	GGC	2	6	25090	25095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259048
582	NC_009484	ATC	2	6	25096	25101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259048
583	NC_009484	CCGC	2	8	25110	25117	0 %	0 %	25 %	75 %	148259048
584	NC_009484	TCT	2	6	25151	25156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	148259048
585	NC_009484	ATC	2	6	25165	25170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259048
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589	NC_009484	CGG	2	6	25239	25244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259048
590	NC_009484	CGG	2	6	25256	25261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259048
591	NC_009484	GGT	2	6	25291	25296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	148259048
592	NC_009484	GGA	2	6	25322	25327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	148259048
593	NC_009484	CGA	2	6	25335	25340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259048
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595	NC_009484	GC	4	8	25359	25366	0 %	0 %	50 %	50 %	148259048
596	NC_009484	CTG	2	6	25390	25395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259048
597	NC_009484	ATC	2	6	25435	25440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259048
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599	NC_009484	GTC	2	6	25546	25551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	148259048
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606	NC_009484	CCCG	2	8	25761	25768	0 %	0 %	25 %	75 %	148259049
607	NC_009484	GC	3	6	25784	25789	0 %	0 %	50 %	50 %	148259049
608	NC_009484	CG	3	6	25816	25821	0 %	0 %	50 %	50 %	148259049
609	NC_009484	AAC	2	6	25872	25877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	148259049
610	NC_009484	CTC	2	6	25910	25915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	148259049
611	NC_009484	GCC	2	6	25919	25924	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259049
612	NC_009484	CGC	2	6	26003	26008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259049
613	NC_009484	CGC	2	6	26036	26041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259049
614	NC_009484	GGCG	2	8	26048	26055	0 %	0 %	75 %	25 %	148259049
615	NC_009484	CGC	2	6	26157	26162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259049
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619	NC_009484	CCG	2	6	26417	26422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259050
620	NC_009484	CGGG	2	8	26438	26445	0 %	0 %	75 %	25 %	148259050
621	NC_009484	GCA	3	9	26456	26464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	148259050
622	NC_009484	CGG	2	6	26505	26510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259050
623	NC_009484	GCC	2	6	26619	26624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259050
624	NC_009484	GCG	2	6	26642	26647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	148259050
625	NC_009484	GCC	2	6	26667	26672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259050
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627	NC_009484	TCA	2	6	26708	26713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	148259050
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756	NC_009484	CGC	2	6	31717	31722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	148259055
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